DNA模板浓度在STR分型图谱均衡性及位点检出数上有很大影响。相对于新鲜样品,扩增甲醛固定组织对DNA模板浓度的要求尤为苛刻,其检测成功所要求的模板浓度范围的宽容度更小。浓度低的低拷贝数模板容易造成检测失败,浓度过高则会带来潜在抑制剂浓度也相对过高,导致STR小片段优势扩增,而大片段收到抑制,影响各STR位点复合扩增的均衡性,甚至导致较长片段STR位点或等位基因丢失。因此,必须摸索出最佳扩增浓度。实验结果表明,甲醛固定组织的模板DNA在去除抑制剂,纯度较高的情况下,浓度高一些对STR分型更为有利,可以增加扩增效率,一般而言,适宜的模板DNA浓度为1-5ng/ul。
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